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JAMA Oncology:多基因測序正在迅速取代BRCA1/2測序
來源:新浪   發布者:張小圈   日期:2018-05-16   今日/總瀏覽:4/3765

好萊塢女星安吉麗娜?朱莉,通過基因檢測發現由于遺傳原因,自己攜帶了BRCA基因,醫生告訴她患乳腺癌的幾率有87%,患卵巢癌的幾率有50%。于是,她為了預防癌癥,先是于2013年切除了乳腺,約2年后接著又切除了卵巢和輸卵管,震驚世界。

而實際上,新診斷為癌癥的患者,也可以通過腫瘤基因檢測,指導二級預防和靶向治療,從而有可能減輕疾病負擔。

而且,隨著新一代、高通量并行測序技術發展和監管政策改革,低成本多基因測序,越來越普遍用于癌癥風險評估。例如:20年前乳腺癌基因檢測曾經只常規測BRCA1/2基因,而如今,已廣泛引入了多達90個乳腺癌多基因測序,而不單只有女神朱莉帶熱的BRCA基因檢測。

腫瘤基因檢測,如何合理地納入新診斷癌癥患者的臨床實踐, 以及基因檢測結果對治療決策的影響,也成為了研究熱點。

近日,斯坦福大學的研究人員,從2013-2015年間新診斷為乳腺癌患者人群的社區臨床實踐中,分析對比了單純BRCA1/2測序與多基因測序的可接受度、對患者預后結局的影響等。相關研究結果發表在《JAMA Oncology》雜志上。

他們發現:多基因測序正在迅速取代BRCA1/2測序,多基因測序對于臨床相關病態突變的檢出率提高至2倍以上,而并沒有導致預防性乳房切除手術的增加。然而臨床上,多基因測序存在兩個有待改進的問題:一是應用時機存在延遲,有些患者延遲到手術后才進行檢測;二是對于意義不明確的突變的檢出率,存在非常明顯的種族/民族差異。

多基因測序對比單純BRCA1/2測序,相應的核心數據如下:

前者正在快速取代后者,從2013年到2015年僅僅2年間,多基因測序使用率從2013年的25.6%飆升至2015年的66.5%,相反,BRCA1/2測序使用率從2013年的74.4%驟降至2015年的33.5%;

多基因測序提高了對癌癥相關突變的檢出率,多基因測序對于高?;颊吆蜔o特殊風險患者的檢出率分別是12%和4.2% ;單純BRCA測序對于高?;颊吆蜔o特殊風險患者的檢出率分別是7.8%和2.2%;

多基因測序沒有增加預防性乳腺切除率, 檢出BRCA1/2突變時的手術率最高(79%),檢出其他相關突變時的手術率僅僅37.6%;

多基因測序相比BRCA1/2測序,更多見測序時間延遲,更多患者可能被推遲到手術切除腫瘤之后才考慮實施多基因測序 (發生率:32.5% vs 19.9%)。

多基因檢測越來越受歡迎,更有可能檢測出的臨床意義未明的基因突變,理論上這將會導致更多的女性因為擔心癌變而不得不高度警惕,更多傾向考慮預防性乳切除。但事實恰恰相反,多基因測序的結果,并未出現手術增加。

這反映了,臨床醫生越來越認可, 多基因測序可以同時為患者及其突變攜帶者親屬,提供更多的臨床有用信息。

▲多基因測序正在迅速取代BRCA1/2測序(圖片來源:JAMA Oncology)

“這點是非常重要的,因為多基因測序揭示患者親屬中致癌基因突變攜帶者,可及時提供基因靶向治療、癌癥一級預防的機會?!毖芯孔髡?、斯坦福大學醫學教授Allison Kurian博士表示:“先前的研究表明,這種針對患者親屬的多基因級聯測序(cascade testing),是極具成本效益的,目前備受推崇,正在開展多個相關的倡議項目?!?/span>

多基因測序的時間滯后問題,可能會不利于患者的治療決策。盡管大多數的女性在手術前完成了多基因測序,但仍然有一些患者的多基因測序,并沒有在手術前進行,而是拖延到了手術后。

這可能是因為:臨床醫生認為,多基因測序的判讀很復雜,需要額外請遺傳咨詢專家會診,并不容易及時做到這一點。另外,組織病理結果相比基因測序結果,更能夠直接用于指導治療選擇。

“基因檢測正在朝著全面測序的方向發展,而且成本也越來越低,我們開始發現,基因顧問團隊,越來越短缺?!?Kurian博士說:“我們需要增強基因咨詢師隊伍,他們應該被納入到常規的癌癥護理團隊中。我們還需要建立新的癌癥護理模式,以有效地分流出適當的患者,及時接受專業的遺傳咨詢?!?/span>

參考資料:

[1] Uptake, Results, and Outcomes of Germline Multiple-Gene Sequencing After Diagnosis of Breast Cancer

[2] Multigene testing replacing BRCA tests for breast cancer risk, Stanford researcher says

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